导致自然流产的原因较多，主要有：

　　1遗传基因缺陷：夫妇任何一方有染色体异常可传至于代，染色体异常的胚胎有50%一60%发生早期自然流产。染色体异常包括：①数目异常：多见三体X单体三倍体等。②结构异常：多为染色体断裂倒置缺失和易位。染色体异常的胚胎即使少数妊娠至足月，出生后会发生畸形或有功能缺陷。如发生流产，妊娠产物有时仅为一空孕囊或已退化的胚胎。

　　2母体因素

　　(1)全身性：妊娠期患全身性感染，高热可引起收缩导致流产。细菌毒素和病毒(如单纯疱疹病毒巨细胞病毒等)通过胎盘进入血循环，使胎儿导致流产;孕妇患严重或心力衰竭可致胎儿缺氧，也能引起流产;孕妇患慢性肾炎或高血压，胎盘发生梗死也可引起流产。

　　(2)生殖器官异常：子宫畸形(如子宫发育不良双子宫子宫纵隔等)子宫(如粘膜下肌瘤等)，均可影响胚胎着床和发育而导致流产。宫颈重度裂伤宫颈内口松弛导致胎膜早破而发生晚期自然流产。

　　(3)内分泌异常：甲状腺功能减退症严重未能控制黄体功能不足，均可导致流产。

　　(4)不良习惯：过量吸烟酗酒，过量饮海洛因等毒品，均可引起流产。

　　(5)创伤刺激：严重休克，子宫创伤(如手术，直接撞击，夫妻生活过度)亦可导致流产;过度紧焦虑恐惧忧伤等精神创伤也有引起流产的报道。

　　3免疫功能异常：妊娠类似同种异体移植，胚胎与母体间存在复杂而特殊的免疫学关系，使胚胎不被排斥。若母儿双方免疫不适应，则可引起母体对胚胎排斥而致流产。与流产有关的免疫因素有父方的相容性抗原(HLA)胎儿抗原血型抗原(ABO及Rh)孕期母体封闭抗体不足母体抗父方淋巴细胞的细胞毒抗体不足孕妇抗磷脂抗体产生过多抗抗体的存在等。

　　4环境因素：砷铅甲醛苯氯丁二烯氧化乙烯等化学物质的过多接触，均可引起流产。